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イメージンクに関するサイレントキーワード 3D が含まれる科研費採択研究4件

イメージンクに関するサイレントキーワード 3Dが含まれる科研費採択研究 4件

個体まるごと用いた4次元イメージングによる形態形成運動の定量的解析
【研究分野】発生生物学
【研究領域課題番号】21770241 (KAKENデータベースで見る）
【研究キーワード】

末梢神経 / 3Dライブイメージング / 進化 / 3D / ホヤ / 神経管閉鎖 / 脊索動物 / 尾芽胚 / 器官形成 / 脊索 / 形態形成 / ASNET / イメージング
【研究成果の概要】

脊索動物の形態形成過程を細胞レベルで理解するために、本研究では、個体を構成する細胞数が少なくシンプルな体制をもつホヤを用いて個体まるごとの1細胞レベルイメージングを行った。ホヤ幼生ひのう部における新規末梢神経ネットワーク構造の3Dイメージングや尾芽胚の3Dコンピュータモデル化、および神経管閉鎖過程の3Dライブ(4D)イメージングを行い、ホヤ胚発生におけるさまざまな形態形成過程を細胞レベルで明らかにすることができた。
【研究代表者】

堀田耕司慶應義塾大学理工学部講師 (Kakenデータベース)
【研究種目】若手研究(B)
【研究期間】2009 - 2011
【配分額】4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)

可搬型複合ライダーの開発と植物計測への応用

【研究分野】農業情報工学

【研究領域課題番号】20380144 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

イメージング / ライダー / 植物計測 / 3D / クロロフィル蛍光 / リモートセンシング / PRI / 可搬型レンジライダー / LAD / LAI / ケヤキ群落 / コムギ群落 / 除草剤 / 植物色素 / 可搬型レンジライダ

【研究成果の概要】

可搬型スキャニングライダーを用いて、ケヤキ群落の葉面積密度(LAD)や葉面積指数(LAI)、葉傾斜角などを推定する手法を開発した。また、レーザービームカバレッジ指数を考案し、この指数が2以上でLADの推定精度がよくなることを示した。さらに、葉と茎の分離が困難なコムギ群落において、植物面積密度(PAD)と植物面積指数(PAI)を推定した。加えて、茎葉や穂の地表面あたりの面積比から乾物重を得るための関係を示した。さらに、3次元クロロフィル蛍光画像計測システムを開発し、メロン個体の時空間的な除草剤影響を解析した。

【研究代表者】

大政謙次東京大学大学院・農学生命科学研究科教授 (Kakenデータベース)

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2008 - 2010

【配分額】19,370千円 (直接経費: 14,900千円、間接経費: 4,470千円)

【研究分担者】
清水庸	東京大学	大学院・農学生命科学研究科	助教	(Kakenデータベース)

【研究協力者】
細井文樹	東京大学	大学院・農学生命科学研究科	講師	(Kakenデータベース)

化学発生生物学展開のためのホヤを用いた小分子化合物高速スクリーニング
【研究分野】生物分子科学
【研究領域課題番号】20200034 (KAKENデータベースで見る）
【研究キーワード】

ホヤ / ケミカルゲノミクス / 小分子化合物 / 創薬 / スクリーニング / 3D / データベース / 神経管閉鎖 / FGFR / 小分子へ化合物 / RT-PCR / 化学発生生物学 / イメージング / 3次元 / whole-animal screening / ハイスループット / 放線菌 / 3次元表現型データベース
【研究成果の概要】

阻害剤のような化合物を用いると標的タンパク質の機能を簡便にノックダウンできるため、標的分子の機能類推が迅速にできる。発生の早いホヤとこのような化合物を組み合わせ高速・高精度な化合物による標的分子機能解析を目指した。本研究ではカタユウレイボヤを用いた化合物スクリーニング系を立ち上げ、実際に標的既知化合物を用いたホヤ標的分子の機能類推を行った。また、「過去の化合物とホヤに関する知見」を集約しまとめた。
【研究代表者】

堀田耕司慶應義塾大学理工学部講師 (Kakenデータベース)
【研究種目】新学術領域研究(研究課題提案型)
【研究期間】2008 - 2010
【配分額】31,460千円 (直接経費: 24,200千円、間接経費: 7,260千円)

【研究分担者】
田代悦慶應義塾大学理工学部講師 (Kakenデータベース)

細胞極性形成機構の三次元網羅解析
【研究分野】発生生物学
【研究領域課題番号】18770207 (KAKENデータベースで見る）
【研究キーワード】

形態形成 / 細胞極性 / ホヤ / 三次元 / データベース / イメージング / 発生ステージ / body atlas / 原腸陥入運動
【研究成果の概要】

ホヤ胚における体構築を共焦点レーザー顕微鏡により,3次元的に画像取得し,実際に1細胞レベルの解像度で個体全体を俯瞰できる画像データベースFABAおよびFABA2(http://chordate.bpni.bio.keio.ac.jp/faba2/2.0/top.html)を開発した.さらにこのFABAにおける3次元胚画像をもとに、原腸陥入期における個体全体の細胞の形態変化を定量化し脊索形成に重要な遺伝子の過剰発現胚における形態異常の検出に応用した。その結果、脊索遺伝子の過剰発現胚の形態異常を定量的に検出できた.
【研究代表者】

堀田耕司慶應義塾大学理工学部助教 (Kakenデータベース)
【研究種目】若手研究(B)
【研究期間】2006 - 2008
【配分額】3,910千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 210千円)

【研究分担者】
田代悦	慶應義塾大学	理工学部	講師	(Kakenデータベース)