水田土壌の脱窒微生物群の系統・機能遺伝子解析とコミュニティゲノミクスの基盤形成
【研究分野】植物栄養学・土壌学
【研究キーワード】
水田土壌 / 脱窒細菌 / 土壌核酸 / SIP解析 / FSC分離法 / クローンライブラリ解析 / 脱窒機能遺伝子 / 16S rRNA遺伝子 / 土壌DNA / 土壌RNA / 定量PCR / 土壌微生物 / nirS / nirK / 16S rRNA / 群集構造解析 / 亜硝酸還元酵素遺伝子 / Stable Isotope Probins法
【研究成果の概要】
水田は温室効果ガスN_2Oの発生や地下水を汚染する硝酸の溶脱の少ない環境保全型農地である。これは水田土壌の高い脱窒活性に由来するが、脱窒を担っている土壌微生物は良く分かっていなかった。本研究では、いくつかの異なる手法を用いて水田土壌で機能している脱窒細菌群を詳細に明らかにした。また、得られた遺伝子情報を利用して土壌の脱窒菌や脱窒活性の遺伝子診断を行う手法について、その基盤を整えた。
【研究代表者】
【研究分担者】 |
| 大塚 重人 | 東京大学 | 大学院・農学生命科学研究科 | 准教授 | (Kakenデータベース) |
|
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2007 - 2009
【配分額】19,760千円 (直接経費: 15,200千円、間接経費: 4,560千円)