【研究分野】生体生命情報学

【研究領域課題番号】18300100 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

DNA Computing / Genetic Program / Whiplash PCR / Displacement Whiplash PCR / Crossover / TAT System / Hybridization Error / Readout method / Efficiency / TAT system / Displacement WPCR / Real Time PCR / Readout / Automation

【研究成果の概要】

本研究では、DisplacementWPCR(DWPCR)を実験により実証し、WhiplashPCRの等温・高効率プラットホームとして確立した。主な実績には以下が含まれる:(1)ルールプロテクト・バイオステップによるバックハイブリダイゼーション排除効果の実証、(2)マルチステップDWPCRの実行および最適化、(3)ルールスイッチ・バイオステップ実行のためのルールプロテクトの使用-これによりDWPCR ミクスチャの外部制御が可能となり、二次的生物学的・計算プロセスとの直接的統合への道が開かれる、(4)DWPCRクロスオーバー(EvolutionaryWPCR の基本演算)の基本的実行可能性の実証。その他、TaqmanプローブとリアルタイムPCR に基づく改良DNA読み出し法の開発、またDNAシステムをシミュレーションし、ハイファイDNAコード化を進化させるNucleicParkソフトウェアツールの改良も実績に含まれる

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2006 - 2008

【配分額】14,610千円 (直接経費: 12,900千円、間接経費: 1,710千円)