転写のダイナミクス解析と高精度シミュレーションに関する研究
【研究分野】生体生命情報学
【研究キーワード】
転写 / シミュレーション / RNAPII / RNA / セルオートマトン / バイオインフォマティクス
【研究成果の概要】
遺伝子のDNA配列を鋳型にRNAポリメレースという酵素によってRNAが作られ、RNAの配列をもとに蛋白質が作られることは、生命の基本原理と考えられている。本研究では転写におけるRNA polymerase II(RNAPII)の運動をエクソン-イントロン間の速度変化を定式化することで、高精度な数値シミュレーションを行った。血管の細胞の主要な遺伝子について、刺激直後からRNAの転写が遺伝子上を波のように遺伝子を伝搬していき、安定的に転写をする状態になってゆく様子を再現することができた。
【研究代表者】
【研究種目】若手研究(B)
【研究期間】2010 - 2011
【配分額】3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)