【研究分野】基礎ゲノム科学

【研究領域課題番号】20241045 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

ゲノム進化・再編 / ChIP-chip / 転写制御ネットワーク / ChAP-chip / Fur / H-NS / Zur / 転写ネットワーク / 大腸菌 / 病原性大腸菌 / 転写制御システム / ChIP-chip解析 / ChIP-seq解析

【研究成果の概要】

ChIP-chipおよびChAP-seqを用いて、複数の大腸菌種におけるグローバルレギュレーターの結合領域を比較することで、大腸菌のゲノム多様性の獲得と転写ネットワークの変化がどのように関係するかを検討した。その結果、今回検討した転写因子では、大腸菌株間における結合プロファイルの保存性が極めて高く、転写因子が制御する遺伝子に変異が生じた場合でも、その結合プロファイルは維持されることが示唆された。

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2008 - 2010

【配分額】50,440千円 (直接経費: 38,800千円、間接経費: 11,640千円)