超多次元拡張パラメータによる出芽酵母の表現型クラスターの解析
【研究分野】遺伝・ゲノム動態
【研究キーワード】
出芽酵母 / 表現型解析 / 画像解析 / 細胞形態 / 自然淘汰 / 遺伝子破壊株 / 液泡 / 酸性化 / バイオイメージング / システムズバイオロジー / オーミクス / オルガネラ
【研究成果の概要】
今まで研究代表者らは出芽酵母の細胞形態を主にして表現型を高次元で定量的に行うことにより、遺伝子欠損による表現型が似ていると遺伝子機能も類似することをゲノム規模で明らかにしてきた。本研究計画ではさらに超多次元の拡張パラメータを作製し、遺伝子産物の局在位置・形態情報を定量化するシステムの構築を行なった。さらに高速化した表現型計測システムを導入することで、標的未知の薬剤について、標的予想を行い、形態プロファイリングによる標的予想システムの有用性を実証した。他のモデル生物でも類をみないこの試みは、細胞システム全体を視野に入れた動作原理の理解につながり、多くの研究者や産業界にとって有用な知的資産になる。
【研究代表者】
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31
【配分額】18,070千円 (直接経費: 13,900千円、間接経費: 4,170千円)