Discovery Sagaサイレントキーワード俯瞰

本研究では、次世代シーケンサーで多数の腹足類の博物館標本からミトコンドリアゲノム全長配列（ミトゲノム）及び18S-rRNA・28srDNA全長配列の決定に加え、それらから有用な部分遺伝子の断片配列マーカーの開発をする。得られたマーカーを更に軟体部や貝殻の博物館収蔵標本のDNA実験に活用をする。最大目標としては、大量なDNA情報や化石・地質学的情報を含むビッグデータセットで腹足類の大系統の解析を行い、腹足類の多様性変動のパターンと地史に起きた環境変動との関連を解明する。
１～２年目の目標には：(1) 博物館標本やフィールドワークからのサンプル採取；（2）一部のサンプルの次世代シーケンサーによるミトゲノム全長配列決定である。目標(1)については、東京大学博物館からのサンプル採取や、インドネシアや日本でのフィールドワークで、ほぼ達成できたと言える。目標(2)については、プロトコルの再確認実験がうまく行ったものの、コロナ禍の影響で実際に決定したサンプル数はまだ１サンプルのみである。この成果について論文報告をして、R3年度の４月ごろに３本の論文が出版された。さらには、手法の確認など派生的な実験の一部からも成果が出ており、それらの論文発表・学会発表も行った。
その後２年目以降には、得られた残りのサンプルの約半分（約800サンプル）のgDNAの抽出が終わったが、コロナ禍の影響でミトゲノム全長配列決定までは全く進んでいない。しかし、本研究にはDNA配列の情報が必要であるため、本研究で開発したプライマーも含むそれらのサンプルの３ー６遺伝子マーカーの部分配列のデータ採取を進めている。従って、２年目から開始する予定の実験（軟体部からのDNAの断片配列の獲得）が順調に進んでいると言える。その１部の結果を学会の査読付きプロシーディングス論文に報告した。

【研究分担者】
佐々木猛智	東京大学	総合研究博物館	准教授	(Kakenデータベース)